光學顯微鏡主要有雙目體視顯微鏡、金相顯微鏡、紫外熒光顯微鏡、電視顯微鏡和電荷耦合器顯微鏡、掃描顯微鏡。分別的用途是：

1、雙目體視顯微鏡在生物、醫學領域廣泛用于切片操作和顯微外科手術；在工業中用于微小零件和集成電路的觀測、裝配、檢查等工作。

2、金相顯微鏡專門用于觀察金屬和礦物等不透明物體金相組織。這些不透明物體無法在普通的透射光顯微鏡中觀察，故金相和普通顯微鏡的主要差別在于前者以反射光，而后者以透射光照明。

3、紫外熒光顯微鏡用于生物和醫學領域。某些標本在可見光中覺察不到結構細節，但經過染色處理，以紫外光照射時可因熒光作用而 發射可見光，形成可見的圖像。這類顯微鏡常用于生物學和醫學中。

4、電視顯微鏡和電荷耦合器顯微鏡可以與計算機聯用，這便于實現檢測和信息處理的自動化，多應用于需要進行大量繁瑣檢測工作的場合。