電子顯微鏡，簡稱電鏡，是根據電子光學原理，用電子束和電子透鏡代替光束和光學透鏡，使物質的細微結構在非常高的放大倍數下成像的顯微鏡，電子顯微鏡由電子流代替可見光，由磁場代替透鏡，讓電子的運動代替光子，這樣就可以看到比光學系統能看到的更小的物體。其放大倍數比較大，基本都是上萬倍。 

      數碼顯微鏡，是通過光學鏡頭，把影像通過CCD 或者CMOS圖像傳感器轉換為模擬信號，然后傳輸到電腦中。實際上就是在光 學顯微鏡的基礎上加了一個數碼成像裝置，可以將顯微鏡所成的像，在電腦屏幕上直接顯示出來（In就推出過一款類似兒童玩具的 “數碼顯微鏡”），其基礎還是光學顯微鏡，和電子顯微鏡的成像原理是有根本區別的。在這里我們要區別清楚分辨率和放大倍數的問題。細微物體在放大成像時，其zui高分辨率取決于所反射的光波的波長，波長越短，分辨率就越高，電子顯微鏡是利用了波長比普通可見光短得多的X 射線成像，當然具備很高的分辨率，而普通 “數碼顯微鏡”的放大倍數可以很大，但分辨率是無法提高的。