超景深顯微鏡通過一系列創新的技術和設計，成功地克服了傳統顯微鏡在觀察微觀世界時看不清的難題。以下是超景深顯微鏡在解決這一問題上的主要方法：

特殊的光源和照明系統：超景深顯微鏡采用特殊的光源和照明系統，確保樣品在較大的深度范圍內得到均勻照明。這種均勻照明有助于減少陰影和反光，使得樣品的不同部分都能清晰地顯示出來。

光學元件和編碼技術：通過使用特殊的光學元件，如菲涅爾透鏡、液晶空間光調制器等，超景深顯微鏡實現對光波前的編碼，從而改變光的傳播特性。這種編碼和改變使得光能夠在一定范圍內增加景深，使得不同深度的樣品部分同時清晰可見。

景深增強技術：超景深顯微鏡的光學透鏡系統中包含特殊設計的元件，如非球面透鏡、多層透鏡組合等，這些元件能夠提升顯微鏡在深度方向的解析能力。通過這些技術，顯微鏡能夠在更大的深度范圍內保持清晰的圖像。

圖像合成與三維重建：超景深顯微鏡通過對一系列不同焦平面的圖像進行合成，得到一個在更大深度范圍內清晰的圖像。這種方法被稱為焦點堆疊，它有助于在單一視野下觀察到樣品不同深度的細節信息。此外，一些超景深顯微鏡還具備三維重建能力，通過從不同角度或不同焦平面捕獲圖像，并結合精確的校準和算法處理，可以重建樣品的三維結構。

綜上所述，超景深顯微鏡通過優化照明系統、采用特殊的光學元件和編碼技術、以及利用圖像合成與三維重建等方法，成功地克服了傳統顯微鏡在觀察微觀世界時看不清的難題，為科研和醫學等領域提供了強大的工具。